Hay varias maneras de detectar la separación de fases en el combustible. La señal más obvia es la formación de capas visibles en el tanque de combustible o en una muestra de un recipiente transparente. Si puede ver capas distintas en el combustible (normalmente una capa más clara en la parte superior (gasolina) y una capa turbia u oscura en la parte inferior (mezcla de etanol y agua), se ha producido una separación de fases. Otros indicadores incluyen: un fuerte olor a alcohol en el combustible; problemas de rendimiento del motor como funcionamiento irregular, calado o dificultad para arrancar; agua en el recipiente del filtro de combustible; o un cambio significativo en el color o la claridad del combustible. También puede usar pasta detectora de agua en una varilla medidora para comprobar si hay agua en el fondo del tanque. Esta pasta cambia de color al entrar en contacto con el agua. Existen kits de prueba comerciales que pueden detectar la separación de fases antes de que se haga visible. Si sospecha que se ha producido una separación de fases, la única solución es vaciar completamente el tanque y desechar adecuadamente el combustible contaminado, ya que esta condición no se puede revertir con aditivos.

La susceptibilidad de las bombas de combustible de repuesto a los daños causados ​​por el etanol varía significativamente según la calidad y el diseño. Las bombas de repuesto de alta calidad de fabricantes reconocidos suelen incorporar materiales resistentes al etanol similares a los de las bombas OEM y pueden ser igualmente resistentes a los daños causados ​​por el etanol. Sin embargo, las opciones de repuesto más económicas suelen utilizar materiales más económicos que podrían no resistir tan bien las propiedades corrosivas y solventes del etanol. Al seleccionar una bomba de combustible de repuesto, busque aquellas que se anuncien específicamente como "compatibles con etanol" o "aprobadas para E10". Compruebe si el fabricante proporciona información específica sobre los materiales de diafragmas, sellos y componentes internos. Los fabricantes de repuestos de calidad suelen indicar la compatibilidad de sus productos con el etanol en sus especificaciones. El precio puede ser un indicador: las bombas significativamente más económicas pueden utilizar materiales menos resistentes. Para motores fueraborda más antiguos, algunos fabricantes de repuestos ofrecen bombas mejoradas con mayor resistencia al etanol que las originales. Si utiliza una bomba de repuesto con combustibles de etanol, considere realizar inspecciones más frecuentes y, posiblemente, acortar los intervalos de reemplazo como medida de precaución.

Los aditivos de combustible más eficaces para la protección contra el etanol son aquellos formulados específicamente para uso marino con múltiples funciones protectoras. Busque productos que contengan: dispersantes de agua que se unen a las moléculas de agua para evitar la separación de fases; inhibidores de corrosión que forman capas protectoras en los componentes metálicos; estabilizadores de combustible que previenen la oxidación y la degradación; y detergentes que limpian los depósitos desprendidos por el etanol. Los principales fabricantes de motores marinos, como Yamaha (Yamalube), Mercury (Quickleen y Quickstor) y Evinrude (2+4 Fuel Conditioner), ofrecen sus propios aditivos de marca, formulados específicamente para sus motores. Entre las marcas independientes con una sólida reputación se incluyen Star Tron Enzyme Fuel Treatment, ValvTect Ethanol Gasoline Treatment y CRC Phase Guard 4. La eficacia de estos aditivos depende de su uso adecuado: deben añadirse en la proporción correcta y mezclarse bien con el combustible. Para una máxima protección, añada el tratamiento cada vez que reposte, no solo durante los periodos de almacenamiento. Recuerde que, si bien estos aditivos son muy eficaces para prevenir los problemas relacionados con el etanol, no pueden revertir la separación de fases una vez que se ha producido.

Al usar combustibles mezclados con etanol, los expertos de la industria y los fabricantes generalmente recomiendan reducir la vida útil esperada de la bomba de combustible en aproximadamente un 30-50% en comparación con el uso de combustible sin etanol. Por ejemplo, si el fabricante de su motor fuera de borda sugiere reemplazar la bomba de combustible cada 300 horas o 3 años con combustible sin etanol, considere reemplazarla a las 150-200 horas o cada 1.5-2 años si usa regularmente combustible E10. Esta recomendación varía según varios factores: la antigüedad de su motor fuera de borda (los modelos más nuevos tienen mejor compatibilidad con el etanol); la frecuencia de uso de la embarcación (los períodos más largos de inactividad aumentan el riesgo); sus prácticas de almacenamiento (una preparación adecuada para el invierno ayuda); si usa aditivos para combustible de forma constante; y su entorno operativo (el agua salada y la alta humedad aumentan los riesgos relacionados con el etanol). En lugar de confiar únicamente en las horas o el tiempo, también esté atento a las señales de advertencia tempranas de problemas con la bomba de combustible, como arranque difícil, ralentí inestable o problemas de rendimiento. El reemplazo preventivo antes de una falla es particularmente importante con los combustibles de etanol, ya que una bomba defectuosa puede liberar residuos que dañan otros componentes del sistema de combustible.